Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Exo1Q9QZ11 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo1Q9QZ11 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms