Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc39a1Q9QZ03 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms