Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms