Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan3Q9QY33 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan3Q9QY33 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms