Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms