Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms