Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms