Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg2Q9QXK3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms