Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms