Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf1Q9QX66 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms