Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc5Q9QX29 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms