Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msh5Q9QUM7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msh5Q9QUM7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms