Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms