Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Prg4Q9JM99 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms