Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep6Q9JM62 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms