Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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