Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms