Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SacsQ9JLC8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms