Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin3Q9JLB9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin3Q9JLB9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms