Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upk3aQ9JKX8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms