Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms