Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms