Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms