Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ybx3Q9JKB3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms