Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms