Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms