Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms