Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bco1Q9JJS6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms