Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip3Q9JJR9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms