Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms