Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms