Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms