Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms