Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LratQ9JI60 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LratQ9JI60 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LratQ9JI60 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LratQ9JI60 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LratQ9JI60 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LratQ9JI60 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LratQ9JI60 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LratQ9JI60 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LratQ9JI60 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LratQ9JI60 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LratQ9JI60 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LratQ9JI60 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LratQ9JI60 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms