Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcirg1Q9JHF5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms