Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms