Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim39Q9ESN2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms