Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem27Q9ESG4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms