Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms