Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elp4Q9ER73 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elp4Q9ER73 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms