Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clstn2Q9ER65 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms