Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn4aQ9ER60 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn4aQ9ER60 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn4aQ9ER60 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scn4aQ9ER60 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scn4aQ9ER60 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn4aQ9ER60 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms