Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms