Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms