Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf1Q9EPU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpsf1Q9EPU4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf1Q9EPU4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms