Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms