Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms