Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pak1ip1Q9DCE5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pak1ip1Q9DCE5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms