Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabarapQ9DCD6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms