Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms